海洋在这个星球占据面积约为71%，海洋中孕育了无数的种族，除了此前发现的巨鳌族、鲛人族与玄鳞族，深海之中还潜藏着诸多强悍种族：身形细长、浑身覆盖着剧毒棘刺的刺鳞族，它们体型虽不及巨鳌族庞大，却能喷射致命毒液，毒液触之即腐，连法器都能腐蚀，且擅长群体作战，往往数十头一起出动，缠住敌人后喷射毒液，防不胜防；能操控深海暗流的涡旋族，它们无固定形态，化作一团团漆黑的漩涡，能撕裂修士的护体灵力，将敌人卷入漩涡之中，碾碎肉身、吞噬神魂，即便大乘境修士也需谨慎应对；还有栖息在深海火山口附近的炎鳍族，它们浑身覆盖着赤红鳞片，能操控海底岩浆，口中喷吐的岩浆温度极高，可轻易融化修士的防御法器，且肉身强悍，不惧高温与水压，是深海中最具攻击性的种族之一；此外，还有擅长隐匿、能与海水融为一体的幻海族，它们能凭借海水制造幻境，迷惑敌人的感知，趁机发动突袭，常常让修士防不胜防。
这些海洋种族，大多与西方神界有着千丝万缕的联系，玄鳞族、刺鳞族与炎鳍族，常年接收西方三大神殿的资源，同时暗中为西方神界收集深海天材地宝，蛰伏待机，一旦西方神界有需要就会发动进攻，从海底突袭华夏沿海。涡旋族与幻海族虽未直接臣服于西方神界，却也受其蛊惑，对华夏修士充满敌意，只要有修士闯入它们的领地，便会毫不犹豫地发动攻击。
深海清剿，比倭岛练兵更为艰难。海水的压力压制着修士的灵力，昏暗的环境不利于观察敌情，且各大海洋种族熟悉海底地形，擅长伏击与协同作战，常常多种族联手，给陆地修士带来极大的困扰，当初方先觉也在海底吃了不小的苦头，才领悟了水之一道和利用深海中压力让国家制作出重力室，才有他后面实力猛增的一幕。
好在有着林风遥和五位大乘境高手坐镇，再加上修士们经过军事化训练，即便在复杂的海底环境中，也能保持默契配合，五人分工明确，仅在关键时刻把控战局、化解致命危机：苍玄子监测全场战局，防止修士大军陷入合围；玄阳子暗中感知海洋种族的动向，及时将情报传递给前线，点拨修士们运用术法的技巧；清玄道君推演深海地形与水流变化，为修士们规划安全的推进路线，提醒他们防范幻术与暗流伏击；玄宸子布下大范围法则预警阵，一旦有修士遭遇超出自身战力的强敌，便及时发出警示，同时干扰高阶海洋种族的术法运转，为修士们争取调整时间；青冥子则为受伤修士提供疗伤，同时标记深海族群不同人类修士术法的弱点，传递给前线修士。合体境、渡劫境修士按编制分组，成为清剿之战的绝对主力：一部分负责探查地形、防范伏击，一部分负责清剿种族主力，还有一部分负责收集深海中的天材地宝，深海之中的灵玉、海魂珠、万年珊瑚等天材地宝，皆是炼制丹药、法器的绝佳材料，既能提升修士修为，也能增强华夏修真界的资源储备。林风遥则坐镇据点中枢，统筹协调各小队的作战节奏，仅在修士大军遭遇灭顶危机时，才会出手干预，其余时间均以点拨实战技巧、传授对战经验为主，让修士们自主应对战场危机。
清剿之战率先在深海边缘区域打响，此处是鲛人族与刺鳞族的栖息地。鲛人族擅长幻术与控水术，它们操控海水形成巨大的水墙，阻挡修士前进，同时施展幻术，让修士误以为陷入无边深海，迷失方向；刺鳞族则隐藏在水墙之后，趁机喷射毒液，不少修士不慎被毒液击中，护体灵力瞬间被腐蚀，肉身出现溃烂，若非医修及时救治，后果不堪设想。“各排协同作战！一排体修结成防御阵，抵挡水墙冲击；二排术修催动火属性术法，蒸发海水、破解水墙，同时克制刺鳞族的毒液；三排剑修趁机突袭，斩杀鲛人族幻术师；四排医修重点救治被毒液击中的修士！”带队的合体境修士沉声下达指令，修士小队立刻按编制行动，配合默契，有条不紊。
火属性术法与海水碰撞，发出滋滋的声响，漫天水汽升腾，鲛人族的水墙渐渐消融，刺鳞族的毒液也被火焰灼烧殆尽。剑修们趁机冲入鲛人族阵营，精准斩杀擅长幻术的鲛人族修士，失去幻术加持，鲛人族顿时陷入混乱；体修们则正面拦截刺鳞族，凭借防御法器抵挡棘刺攻击，术修们则持续输出，一道道火焰术法击中刺鳞族，将其焚烧殆尽。激战两个时辰后，浅滩区域的鲛人族与刺鳞族被彻底清剿，修士们缴获了大量鲛珠与刺鳞，这些都是炼制防御法器与解毒丹药的绝佳材料。
随着清剿之战的推进，修士们深入深海，遭遇了更为强悍的种族。在深海中部的涡旋地带，修士小队遭遇了涡旋族的伏击，数十团巨大的黑色旋涡突然出现，将数名合体境修士卷入其中，哪怕是合体境的修为都来不及做出反应，瞬间被漩涡碾碎，神魂无存。“所有人收缩阵型，催动灵力结成防御屏障，术修催动风属性术法，吹散漩涡！”带队的渡劫境修士及时下达指令，修士们立刻调整阵型，风属性术修持续催动术法，试图吹散旋涡，体修与剑修则依托防御屏障，奋力抵挡旋涡的拉扯。但涡旋族的威力远超预料，防御屏障渐渐出现裂痕，更多修士陷入危机。
坐镇据点的玄宸子通过法则预警阵察觉到异常，立刻隔空布下“定风锁涡阵”，以天地法则暂时固定周边海水，阻止新的漩涡生成，为修士们争取了调整时间，却并未亲自出手镇杀涡旋族。在玄宸子的暗中点拨下，修士们调整战术，风属性术修集中灵力，专攻漩涡核心，体修与剑修则分成小队，逐一清理小型旋涡，同时搜救被困修士。经过一番激战，虽然付出了不小的伤亡，却也成功打通了前往深海极渊的通道，修士们在这场对战中，也深刻掌握了应对旋涡攻击的技巧，不少合体境修士的灵力操控能力得到显着提升。